Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc155Q80VJ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc155Q80VJ8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc155Q80VJ8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc155Q80VJ8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms