Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTU1Q7Z7A3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTU1Q7Z7A3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTU1Q7Z7A3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms