Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim17Q7TPM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim17Q7TPM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim17Q7TPM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms