Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sbno2Q7TNB8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sbno2Q7TNB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sbno2Q7TNB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms