Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc8Q7TN58 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmc8Q7TN58 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmc8Q7TN58 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms