Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rph3alQ768S4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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