Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC36A4Q6YBV0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC36A4Q6YBV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC36A4Q6YBV0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms