Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ift172Q6VH22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift172Q6VH22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift172Q6VH22 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ift172Q6VH22 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms