Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY52

Gm7247, Predicted gene 7247, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7247Q6UY52 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm7247Q6UY52 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm7247Q6UY52 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm7247Q6UY52 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm7247Q6UY52 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm7247Q6UY52 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm7247Q6UY52 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm7247Q6UY52 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm7247Q6UY52 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms