Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms