Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AtminQ6P9S1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AtminQ6P9S1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AtminQ6P9S1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms