Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND1BQ6P3S1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND1BQ6P3S1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND1BQ6P3S1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND1BQ6P3S1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENND1BQ6P3S1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND1BQ6P3S1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DENND1BQ6P3S1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DENND1BQ6P3S1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms