Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Szrd1Q6NXN1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Szrd1Q6NXN1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Szrd1Q6NXN1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Szrd1Q6NXN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms