Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retreg2Q6NS82 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retreg2Q6NS82 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retreg2Q6NS82 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.5 ms