Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt87Q6IMF0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt87Q6IMF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt87Q6IMF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms