Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam196bQ6GQV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam196bQ6GQV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam196bQ6GQV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam196bQ6GQV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms