Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scaf8Q6DID3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scaf8Q6DID3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scaf8Q6DID3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms