Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx11Q6AXC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx11Q6AXC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx11Q6AXC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms