Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rftn1Q6A0D4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rftn1Q6A0D4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms