Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
N4bp1Q6A037 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
N4bp1Q6A037 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
N4bp1Q6A037 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms