Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Top2bQ64511 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Top2bQ64511 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Top2bQ64511 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Top2bQ64511 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms