Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pou4f3Q63955 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pou4f3Q63955 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f3Q63955 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms