Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Znf260Q62513 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf260Q62513 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms