Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Ttf1Q62187 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttf1Q62187 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Ttf1Q62187 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Ttf1Q62187 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ttf1Q62187 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ttf1Q62187 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ttf1Q62187 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf1Q62187 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf1Q62187 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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