Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lama3Q61789 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lama3Q61789 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama3Q61789 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms