Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga6Q61739 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga6Q61739 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Itga6Q61739 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms