Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim25Q61510 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim25Q61510 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim25Q61510 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms