Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mre11Q61216 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mre11Q61216 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mre11Q61216 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms