Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtcfQ61164 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtcfQ61164 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtcfQ61164 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms