Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ppp1r1bQ60829 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ppp1r1bQ60829 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp1r1bQ60829 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp1r1bQ60829 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms