Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf3Q60803 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf3Q60803 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf3Q60803 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms