Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P4ha1Q60715 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P4ha1Q60715 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P4ha1Q60715 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms