Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc27a1Q60714 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc27a1Q60714 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc27a1Q60714 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms