Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm1Q60636 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm1Q60636 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm1Q60636 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 468.8 ms