Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sin3aQ60520 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sin3aQ60520 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sin3aQ60520 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sin3aQ60520 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms