Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT79Q5XKE5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT79Q5XKE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT79Q5XKE5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms