Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp13a4Q5XF90 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp13a4Q5XF90 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a4Q5XF90 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms