Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRAGBQ5VZM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRAGBQ5VZM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms