Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLIPQ5VWP3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MLIPQ5VWP3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MLIPQ5VWP3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms