Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRAMEF20Q5VT98 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRAMEF20Q5VT98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF20Q5VT98 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms