Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NHSL1Q5SYE7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NHSL1Q5SYE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NHSL1Q5SYE7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms