Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CluhQ5SW19 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CluhQ5SW19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CluhQ5SW19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms