Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bbs12Q5SUD9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bbs12Q5SUD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bbs12Q5SUD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms