Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psme4Q5SSW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psme4Q5SSW2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psme4Q5SSW2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms