Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
5730522E02RikQ5SP45 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
5730522E02RikQ5SP45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms