Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Mdc1Q5PSV9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mdc1Q5PSV9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mdc1Q5PSV9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mdc1Q5PSV9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms