Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trim58Q5NCC9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim58Q5NCC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim58Q5NCC9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms