Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NHLRC3Q5JS37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NHLRC3Q5JS37 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NHLRC3Q5JS37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms