Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mdh1bQ5F204 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdh1bQ5F204 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdh1bQ5F204 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mdh1bQ5F204 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.3 ms