Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rtl5Q5DTT4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rtl5Q5DTT4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rtl5Q5DTT4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rtl5Q5DTT4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms